人類腸道微生物

小鼠的新研究現(xiàn)在指出，真菌在腸道中起著重要作用-霉菌和酵母菌的菌群被稱為菌群-是宿主與飲食之間的主動界面。

伯明翰大學(xué)阿拉巴馬大學(xué)助理教授，醫(yī)學(xué)博士肯特·威利斯說：“我們證明健康小鼠的腸道菌群是受環(huán)境影響的，包括飲食，并且與代謝結(jié)果顯著相關(guān)。"該研究的結(jié)果發(fā)表在《通訊生物學(xué)》雜志上。“我們的結(jié)果支持腸道菌群在宿主代謝適應(yīng)中的作用，這些結(jié)果對微生物組研究的設(shè)計和宿主代謝實驗研究的可重復(fù)性具有重要意義。"

威利斯和他的同事研究了小鼠小腸空腸中的真菌，小鼠小腸的空腸是小鼠腸道中真菌種類zui多的部位。他們發(fā)現(xiàn)，與以標(biāo)準(zhǔn)飲食喂養(yǎng)的小鼠相比，暴露于加工飲食(這種飲食代表典型的西方飲食中富含純凈碳水化合物)會導(dǎo)致真菌群落的持續(xù)差異，這與雄性小鼠體重的差異性沉積顯著相關(guān)。 。

研究人員發(fā)現(xiàn)，肝臟中的脂肪沉積，代謝活性組織的轉(zhuǎn)錄適應(yīng)和血清代謝生物標(biāo)志物水平均與真菌群落多樣性和組成的改變有關(guān)。來自兩個屬的真菌(嗜熱霉菌和釀酒酵母)的變異與代謝紊亂和體重增加zui密切相關(guān)。

研究人員還提出了一個基本問題：通過下一代測序檢測到的真菌生物是否來自飲食，或者它們是在腸道中定居并復(fù)制的真正的共生生物?他們比較了含有一些真菌的食物顆粒的測序，小鼠空腸的內(nèi)容物表明空腸真菌是真正的共生菌。

該研究有一個巧妙的起點。研究人員從四個不同的研究動物供應(yīng)商那里獲得了基因相同的小鼠。*，腸道細(xì)菌群落隨供應(yīng)商的不同而顯著不同。類似地，研究人員發(fā)現(xiàn)空腹真菌生物群群的供應(yīng)商差異很大，這是通過對內(nèi)部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)rRNA進(jìn)行測序而測得的。在基線時，來自供應(yīng)商之一的小鼠具有五個*的真菌屬，而來自其他三個供應(yīng)商的小鼠分別具有三個，兩個和一個*的屬。

他們還研究了細(xì)菌群落的組成，即細(xì)菌和真菌，并發(fā)現(xiàn)了較大的基線細(xì)菌群落差異。他們從zui初的真菌和細(xì)菌多樣性出發(fā)，測量了時間和飲食差異(標(biāo)準(zhǔn)化食物與高度加工飲食之間的差異)對真菌和細(xì)菌群落組成的影響。